Skyrim tiene lugar doscientos años después de lo ocurrido en Oblivion, por lo que no es una continuación o secuela. El juego se asienta en los terrenos de la provincia de Skyrim, que se encuentra en plena guerra civil fraticida entre dos facciones enfrentadas política y militarmente: «Los capa de la tormenta» que agrupa a la raza «nórdica» autóctona de Skyrim de un lado, y del otro «La legión imperial».El despertar de los dragones
La historia inicia con el personaje del jugador preso y siendo conducido a la ciudad forticada de Helgen a una ejecución «Imperial». Allí se encuentran a varios militantes de «Los capa de la tormenta» y su líder: Ulfric Capa de la Tormenta. Al llegar a Helgen, pese a no haber sido identificado y a no constar en la lista de candidatos a ejecución, los imperiales deciden ejecutar al jugador. Inesperadamete, un dragón irrumpe deteniendo las ejecuciones, ataca y destruye el poblado. El jugador escapa con la ayuda de un militante imperial y luego debe decidir si seguir el trayecto en compañía de un imperial o de un capa de la tormenta. Hecha la decisión, viajan a la aldea de Cauce Boscoso, una caserío cercano a Helgen, cuyos habitantes temen que, en cualquier mometo, el dragón atacará su pueblo. Se le pide que vaya a la ciudad amurallada de Carrera Blanca a solicitar la ayuda del jarl —título nobiliario del juego que equivale a duque— de la ciudad, para hacerle frente a la amenaza del dragón. El jarl Balgruuf el Grande acepta y le pide al jugador que hable con «Farengar Fuego Secreto» el mago de la corte, este le pide que encuentre y le traiga la «Piedra del dragón», que es una tablilla mágica que muestra la localización de los túmulos de los dragones.Los barbas grises
De regreso a Carrera Blanca y llevando consigo la «Piedra del dragón», el jugador descubre que otro dragón ha hecho aparición cerca de la ciudad. Luego de matarlo, con la ayuda de los guardias, el personaje del jugador absorbe el alma del dragón que le concede la habilidad mágica llamada Thu'um o «Grito de dragón». Al ver esto, los guardias quedan estupefactos y le informan al jugador que él debe ser el «Sangre de dragón»: un mortal con alma de dragón. Luego de ir con el jarl a contarle la buena nueva de la derrota y muerte del dragón, el jugador es convocado místicamente para que se encuentre con los «Barbas grises»: una orden de monjes recluidos en el templo «Alto Hrothgar», que se encuentra en las faldas de «La garganta del mundo», la montaña más alta de Skyrim.
Estos inician al jugador en el «Camino de la voz», le enseñan el Thu'um más poderoso y le instruyen sobre su destino y responsabilidad como un «Sangre de dragón». Se entera de que la guerra civil que asola a Skyrim significa que la última profecía se ha cumplido, tal como fue predicho por los Elder Scrolls (los ancestrales, sapiensales y venerables rollos), que también predijeron el regreso del dragón-dios Alduin y que está profetizado que destruirá a las razas «men» y «mer», y devorará el mundo. El personaje del jugador es último Dovahkiin o «Sangre de dragón», un ser que contiene en su cuerpo mortal el alma de un dragón. Los Dovahkiin son ungidos por los divinos para ayudar a defender a la provincia de Skyrim y al continente de Tamriel contra Alduin y otros dragones.
Los cuchillas
Los barbas grises encomiendan al jugador la misión de recuperar el «Cuerno de Jurgen Llamador del Viento». Sin embargo, el jugador descubrirá que el «cuerno» ha sido robado por aquel que desea reunirse con el «Sangre de dragón». Tal ladrón resulta ser Delphine, la posadera de Cauce Boscoso y una de los últimos miembros sobrevivientes de la «Orden de los cuchillas», que era una hermandad de escoltas que juraron proteger al emperador «Imperial». Delphine y el jugador precencian la resurrección de un dragón de entre un túmulo, se enfrentan a él y lo derrotan. Más adelante, Delphine ayuda al jugador a infiltrarse en la embajadaThalmor, que está cerca de la ciudad amurallada de «Soledad» y en esta se ubican los cuarteles del «Dominio Aldmer» en la provincia de Skyrim. Una vez dentro debe ayudarle a seguirle la pista basada en la sospecha que tiene contra los Thalmor, pues ella cree que están involucrados con el ataque del dragón. Estando allí,Delphine y el jugador descubren que los Thalmor están buscando a un «hombre» llamado Esbern, un archivista de la «Orden de los cuchillas». Luego, Delphine le encomienda al jugador que localice a Esbern en las alcantarillas y cloacas de la ciudad amurallada de «Riften».
El jugador, en compañía de «Los cuchillas» parten a la búsqueda del «Muro de Alduin» el cual tiene grabada una profecía y está situado en la antigua fortaleza de «Los cuchillas» conocida como el «Templo del Refugio Celestial». Entre tanto «Los cuchillas» preparan el templo, el jugador aprende que los antiguos «nórdicos» usaban contra Alduin un Thu'um especial llamado «Desgarro de dragones», símbolo del profundo odio que la humanidad siente hacia los dragones, este «grito» impide que el dragón vuele, forzándolo a aterrizar y así poder atacarlo. Para recopilar más información, el jugador debe encontrarse con el anciano dragónPaarthanux, líder de «Los barbas grises» que antaño fue uno de los generales más temidos de Alduin. Este revela que en el pasado Alduin no fue derrotado realmente; mas fue enviado al futuro, mediante el uso de un venerable rollo, un Elder Scroll, a una fecha indeterminada con la esperanza de que se perdiese. El jugador puede encontrar este ancestral rollo (Elder Scroll) al interior de las antiguas ruinas Dwemer de «Límite sombrío», y debe usarlo para mirar a través de la ventana del tiempo y aprender el poderoso grito «Desgarro de dragones» y poder combatir contra Alduin.
El pergamino antiguo
Armado con el conocimiento de cómo los antiguos «nórdicos» derrotaron a Alduin, el jugador se enfrenta en lid contra este en la cima de la «Garganta del mundo». Al verse sobrepasado por el jugador, Alduin huye al más allá «nórdico»: Sovngarde. El jugador descubre que «Cuenca de dragón», el palacio del jarl de la ciudad amurallada de «Carrera Blanca», fue construido con el propósito de capturar y retener un dragón. Balgruuf se rehúsa a permitir que el jugador utilice su castillo para realizar un conilio entre «Los capa de la tormenta» y la «Legión Imperial», temiendo la posibilidad que estos últimos se traben en batalla y la ciudad resulte perjudicada. Sin embargo y gracias a «Los barbas grises» el concilio se celebra con éxito pues se logra un armisticio condicionado a la existencia de la amenaza del dragón. Si antes de esto, la guerra ya ha cesado, el jarl eventualmente accede al «persuadirlo».
El jugador conjura al dragón Odahviing y lo encierra en «Cuenca de dragón»; por él se entera que Alduin ha escapado a Sovngarde por un portal situado en lo alto de las montañas en un antiguo templo fortificado llamado «Skuldafn». Odahviing queda impresionado con el Thu'um del jugador y de su destreza para atraparlo, por esto se compromete a llevar al jugador en su lomo e ir volando a «Skuldafn», pues alega que Alduin se ha mostrado débil e indigno de ser el líder de los dragones. Ya en Skuldfan el jugador viaja a Sovngarde y se encuentra con Ysgramor, legendario héroe «nórdico» que junto a los «Quinientos compañeros», expulsó a los elfos de la provincia de Skyrim. Ysgramor le dice al jugador que Alduin ha dispuesto una «trampa de alma» en Sovngarde, lo que le permitirá recuperar fuerza al devorar las almas de los difuntos «nórdicos» que caigan en ella. Luego, el jugador se encuentra con los tres héroes legendarios «nórdicos» que fueron quienes derrotaron a Alduin por primera vez, y con su ayuda destruye la «trampa de alma» y derrota a Alduin.
Si el jugador no mata a Paarthurnax en una misión alternativa anterior a todo esto, existe una conclusión alterna. El jugador regresa a las faldas de «La garganta del mundo» con Paarthurnax mientras los otros dragones esperan. Este explica que aunque Alduin sea derrotado, no lo celebrará pues fue su aliado y es uno de sus parientes. Después de reafirmar su autoridad, Paarthurnax convence a los dragones leales a él para que abandonen el continente de Tamriel.
